Хороший вопрос, я тоже пытался его решить. К сожалению (или наоборот), хотя Институт и назначен главным бякой четвёртой части — реально он не выглядит таким злодеем, чтобы все так уж рвались кровь из носу но разрушить его. БС только я понимаю — у них идея фикс быть монопольными владельцами всех технологий, им всегда надо забрать что можно а что нельзя разрушить. Ну а Вирджил — с ним всё совсем непонятно, одни догадки. Можно предположить что он бедная жертва злой бяки, но с равной вероятностью можно предположить и то что сам Вирджил занимался созданием супермутантов, и за это его работу в институте прикрыли, он обыделсо и сбежал от угнетателей…